În timpul istoriei sale, biserica a servit ca loc de închinare pentru mai multe confesiuni religioase, inclusiv catolici, luterani și calviniști. În prezent, biserica este folosită în principal ca loc de cult catolic și găzduiește, de asemenea, concerte de muzică clasică, datorită acusticii excelente.
Biserica Sfântul Nicolae din Malá Strana este o atracție turistică populară în Praga, fiind vizitată de mulți turiști care doresc să exploreze frumusețea și istoria orașului. Vizitarea bisericii este o experiență impresionantă, care oferă o priveliște impresionantă asupra arhitecturii baroce și a artei religioase din Europa Centrală.